De viktigaste monumenten och arkitektoniska strukturerna på den arkeologiska platsen Gournia är följande:
Den obefästa staden bredde ut sig över sluttningarna av en låg kulle. Två yttre stenlagda vägar, korsade av vinkelräta gator som ofta var trappformade och anslutna till ett dräneringssystem, bildade kvarter som redan till stor del har grävts ut (sju kvarter). De tvåvåningshus som fanns här (de största cirka 5 × 5 m) delade ytterväggar. I dag återstår främst förråds- och verkstadsutrymmen på bottenvåningen samt källare, som nåddes via trästegar uppifrån. Övervåningen, där bostadsrummen låg, nåddes direkt från gatan via trappor. De nedre väggarna var byggda av sten, medan övervåningen bestod av soltorkat lertegel.
Gournia ger en bild av minoernas vardagsliv, där man ägnade sig åt jordbruk, boskapsskötsel, fiske, keramik och vävning, vilket bekräftas av fynd av verktyg (mejslar, fiskkrokar, hammare m.m.). Även mer exklusiva kärl har hittats, såsom rhyton och rituella kärl.
Palatset — säte för en lokal härskare — ligger på kullen ovanför en rektangulär gårdsplan, från vilken flera privata bostäder nåddes. Det fungerade sannolikt som bosättningens centrum och möjligen även som marknadsplats. På södra sidan finns en rad trappstegsformade sittplatser i Γ-form, riktade mot gården, som troligen användes av åskådare vid religiösa ceremonier — ett tidigt ”teatraliskt rum”.
Bakom trappan finns ett mindre rum vars golv består av en stenplatta med hål, tolkad som en offerplattform, möjligen för tjuroffer. Intill finns en ”kernos”, en liten sten med fördjupningar för offergåvor. Palatsets västra sida hade ett monumentalt uttryck med dekorativa nischer, utskjutande partier, en central ingång och fönster som inte längre finns kvar.
Palatsets inre är dåligt bevarat men omfattade officiella rum samt lagerutrymmen, ovanpå vilka större salar sannolikt fanns. Den centrala salen var skild från gården genom en kolonnad av runda träkolonner omväxlande med fyrkantiga stenpelare. Norr om palatset, fristående från det, finns en liten offentlig helgedom tillägnad den minoiska ormgudinnan. Den är tillgänglig via en återvändsgränd och består av ett kvadratiskt rum (3 × 4 m) med en bänk för kultföremål samt fynd som terrakottafigurer av gudinnan med uppsträckta armar, ett trebent altare och ormliknande kultföremål.