Po podboju osmańskim Rethymno w 1646 roku struktura twierdzy pozostała w zasadzie niezmieniona, choć liczba budynków mieszkalnych wewnątrz wzrosła. Od XX wieku mieszkańcy byli stopniowo przesiedlani, a zrujnowane obiekty zostały rozebrane przez gminę, służbę archeologiczną oraz Grecką Organizację Turystyczną w celu przywrócenia historycznego charakteru miejsca. Obecnie zamek jest najważniejszym zabytkiem Rethymno i służy jako miejsce wydarzeń kulturalnych. Wewnątrz zachowały się Sultan Ibrahim Mosque oraz Erofili Municipal Theatre, choć wiele budowli z okresu weneckiego i osmańskiego zostało zniszczonych. Obwód twierdzy jest niemal w całości zachowany i obejmuje cztery główne półbastiony, dodatkowe wysunięte elementy obronne oraz trzy bramy. Główne wejście znajduje się od strony wschodniej, natomiast wejścia pomocnicze od północy i zachodu. Bezpośrednio za główną bramą znajdują się magazyn artylerii, centralny plac twierdzy z meczetem oraz dawne budynki kościelne i administracyjne, a także prawdopodobne pomieszczenia więzienne. Na wysuniętych częściach zamku znajdowały się kiedyś kwatery oficerów i magazyny, w tym kompleks przy bramie północnej. Zachowały się również niektóre stare budynki o nieznanym przeznaczeniu, mała XIX-wieczna kaplica, rozproszone prochownie oraz cysterny na wodę.