Materyal ve dijital koleksiyon, beş tematik bölümde sunulmaktadır: 1. Kazantzakis’in insanı 2. Kazantzakis’in „Odysseia“sı 3. Yazışmalar, dostluklar ve etkiler 4. Erken dönem eserleri, tiyatro oyunları ve „Askesis“ 5. Romanlar ve seyahat eserleri Ayrıca ziyaretçiler, Nikos Kazantzakis’in hayatı ve eserleri hakkında 11 dilde (Yunanca, İngilizce, Fransızca, Almanca, İspanyolca, İtalyanca, Çince, Korece, Felemenkçe, Lehçe ve Rusça) hazırlanmış kısa bir belgeseli izleyebilirler. Çocuklar için özel olarak üretilmiş bir versiyon da bulunmaktadır. İstenirse Yunanca, İngilizce ve Almanca dillerinde kablosuz sesli rehber hizmeti alınabilir veya müzenin bilimsel personeli tarafından Yunanca ve İngilizce rehberli tur planlanabilir. Müze, kalıcı serginin yanı sıra farklı hedef kitlelere yönelik çok yönlü bir etkinlik programı geliştirmektedir. Araştırma kütüphanesi Museum Nikos Kazantzakis bünyesinde Kazantzakis çalışmalarını desteklemekte, her eğitim seviyesindeki okul grupları için eğitim programları düzenlenmekte ve çocuklar, gençler, aileler ve eğitimciler için pedagojik faaliyetler gerçekleştirilmektedir. Ayrıca basılı ve dijital yayınlar hazırlanmakta, konferanslar, atölye çalışmaları, festivaller, konserler ve tiyatro gösterileri gibi kültürel etkinlikler düzenlenmektedir. Kazantzakis arşivinin oluşturulmasına 1976 yılında müzenin kurucusu Georgios Anemogiannis tarafından başlanmıştır. Arşiv, yazarın eşi Eleni Samiou-Kazantzakis’in kişisel mirasının önemli bir bölümünün bağışıyla büyük ölçüde genişletilmiştir. Çok sayıda özel kişi de koleksiyonun zenginleşmesine katkıda bulunmuştur. Günümüzde aktif arşiv yaklaşık 50.000 obje ve belge içermekte olup, on koleksiyon grubuna ayrılmıştır. Müze kuruluşundan bu yana arşiv sürekli olarak genişletilmekte, korunmakta ve bilimsel olarak erişilebilir hale getirilmektedir. Georgios Anemogiannis’in kişisel arşivi de müzeye bırakılmıştır. Dünya çapında en iyi organize edilmiş tiyatro arşivlerinden biri olarak kabul edilir ve 400’den fazla tiyatro prodüksiyonuna ait incelemeler, sahne ve kostüm çizimleri, üç boyutlu maketler, basın makaleleri, fotoğraflar, yazışmalar, defterler, kitaplar ve kişisel eşyaları içermektedir.