De belangrijkste monumenten en architectonische structuren van de archeologische vindplaats Gournia zijn de volgende:
De niet-ommuurde stad strekte zich uit over de hellingen van een lage heuvel. Twee perifere geplaveide wegen, gekruist door loodrechte straten die vaak trapvormig waren en verbonden met een afwateringssysteem, vormden bouwblokken waarvan er inmiddels zeven zijn opgegraven. De tweelaagse huizen (de grootste ongeveer 5 × 5 m) deelden gemeenschappelijke buitenmuren. Vandaag de dag zijn vooral de opslag- en werkruimtes op de begane grond en de kelders bewaard gebleven, die via houten trappen van bovenaf bereikbaar waren. De bovenverdieping, waar de belangrijkste woonruimtes zich bevonden, was rechtstreeks vanaf de straat toegankelijk via een trap. De onderste muren waren van steen, terwijl de bovenverdieping uit lemen bakstenen bestond.
Gournia geeft een beeld van het dagelijks leven van de Minoërs, die zich bezighielden met landbouw, veeteelt, visserij, aardewerk en weven, zoals blijkt uit de gevonden werktuigen (beitels, vishaken, hamers enz.). Ook werden meer verfijnde voorwerpen gevonden, zoals rhyta en rituele vaten.
Het paleis — de zetel van een lokale heerser — bevindt zich op de top van de heuvel, ten westen van een rechthoekig binnenplein van waaruit verschillende privéwoningen toegankelijk waren. Het vormde waarschijnlijk het centrum en mogelijk ook de markt van de nederzetting. Aan de zuidzijde van het paleis bevindt zich een reeks trapvormige zitplaatsen in een Γ-vorm, gericht op het plein. Hier zaten waarschijnlijk toeschouwers bij religieuze rituelen, wat wijst op een primitieve “theatrale ruimte”.
Achter de trap bevindt zich een kleine ruimte met een vloer van een stenen plaat met gaten, geïnterpreteerd als een platform voor offers, mogelijk stierenoffers. Daarnaast bevindt zich een “kernos”, een kleine steen met holtes voor offergaven. De westzijde van het paleis, die uitkeek op een klein geplaveid plein, had een monumentaal uiterlijk met decoratieve nissen en uitsteeksels, een centrale ingang en inmiddels verdwenen ramen.
Het interieur van het paleis is slecht bewaard gebleven, maar omvatte verschillende officiële ruimtes en opslagruimten waarboven waarschijnlijk grotere kamers lagen. De centrale zaal werd gescheiden van het hoofdplein door een zuilengalerij van ronde houten zuilen afgewisseld met vierkante stenen pijlers. Ten noorden van het paleis, los ervan, bevindt zich een klein openbaar heiligdom gewijd aan de Minoïsche slangen-godin. Het is bereikbaar via een doodlopende straat en bestaat uit een vierkante ruimte (3 × 4 m) met een bank aan de zuidzijde voor cultobjecten, waaronder terracotta beeldjes van de godin met opgeheven armen, een drievoetig altaar en slangvormige cultbuizen.