Samlingen suppleres af digitale reproduktioner organiseret i fem tematiske afsnit: 1. Mennesket Kazantzakis 2. Kazantzakis’ „Odysseen“ 3. Korrespondance, venskaber og påvirkninger 4. Tidlige værker, teaterstykker og „Askesen“ 5. Romaner og rejseværker Derudover kan besøgende se en kort dokumentarfilm om Nikos Kazantzakis’ liv og værk, tilgængelig på elleve sprog: græsk, engelsk, fransk, tysk, spansk, italiensk, kinesisk, koreansk, hollandsk, polsk og russisk. Der findes også en særlig børneversion. Efter ønske kan man benytte trådløs audioguide på græsk, engelsk og tysk eller bestille en guidet rundvisning med museets videnskabelige personale (græsk og engelsk). Ud over den permanente udstilling driver museet et bredt aktivitetsprogram for forskellige målgrupper. Dette omfatter et forskningsbibliotek, der fremmer studiet af Kazantzakis’ værk, uddannelsesprogrammer for skolegrupper på alle niveauer samt pædagogiske aktiviteter for børn, unge, familier og undervisere. Desuden udgiver museet trykte og digitale publikationer og organiserer kulturelle arrangementer såsom konferencer, workshops, festivaler, koncerter og teaterforestillinger. Samlingen af Kazantzakis-arkivet blev påbegyndt i 1976 af museumsgrundlæggeren Georgios Anemogiannis. Arkivet blev betydeligt udvidet gennem donationen af en stor del af den personlige arv fra Eleni Samiou-Kazantzakis, forfatterens hustru. Mange private bidragydere har også støttet udvidelsen af samlingen. I dag rummer arkivet omkring 50.000 genstande og dokumenter, organiseret i ti samlingskategorier efter form og indhold. Siden museets grundlæggelse er arkivet løbende blevet udvidet, bevaret og gjort tilgængeligt for forskning. Også Georgios Anemogiannis’ personlige arkiv er blevet testamenteret til museet. Det regnes blandt verdens bedst organiserede teaterarkiver og indeholder studier af over 400 teaterproduktioner, scenografi- og kostumetegninger, tredimensionelle modeller, presseartikler, fotografier, korrespondance, notesbøger, bøger og personlige ejendele.